ツリービューで並び替えが可能なのは、つながり方というものが保存されるべきだという考えからなんですね。一方、リストビューで表示されるのは、なんらかの条件に合致した一時的なリストに過ぎません。なので、リストの順番を保持するということにはなりづらいと思います。

つながりを表示する方法がツリービュー以外にも拡張される、という可能性は十分ありえます。例えば、つながりのあるフラグメントを空間的に自由に配置できるようになれば、magicianさんの希望に近いものになるんじゃないでしょうか。