作者からの回答

tomcat6のページが開かれてしまう
というのは、単にブラウザのキャッシュが残っているか（リロードで解決）、Tomcatが起動したままになっているかのどちらかだと思いますよ。
システム情報の「データベースのタイトル」ですが、これはapplication.propertiesの設定とは無関係です。ユーザー自身がデータベースに分かりやすいタイトルを付ける為に用意された項目です。
piggydb.fragmentsView.defaultScaleの件ですが、反映されませんでしたか。これは現に正しく動作している環境があるので、不具合ということではないと思うのですが、この情報だけだとなんとも判断し難いですねぇ。

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お陰様で全て解決しました。本当にどうもありがとう御座いした。
Q1の原因は、仰るとおりキャッシュでした。アドバイス通り、リロードで一発解決しました。
Q3は、ようやく理解できました。システム情報の｢データベースのタイトル｣はブラウザのタイトルバーに表示される名前だったのですね！
すごくスッキリしました。データベースのタイトルにしては動作が軽すぎて、いつも凄く違和感があったものですから。
Q5についてですが、原因が分かりました。どうも、スライドバーが設定の値に直されるタイミングを勘違いしていたようです。
（今までは、ホームボタンをクリックすると、スライドバーがリセットされると思いこんでいました）
それに気付いてからは、
どちらの方法でも動作を確認しました。
(再起動は、ＰＣごと再起動する必要はなく、単に、｢Stop service｣→｢Start service｣の手順でＯＫでした)
ご迷惑をおかけしました。的確なアドバイス、どうもありがとう御座いました。
P.S.
タグクラウドが復活しましたね！　早くダウンロードできるようになるのを楽しみにしています!!